Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMPDL3AQ92484 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMPDL3AQ92484 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms