Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms