Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RNF148Q8N7C7 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms