Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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CLDN19Q8N6F1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CLDN19Q8N6F1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CLDN19Q8N6F1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CLDN19Q8N6F1 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CLDN19Q8N6F1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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CLDN19Q8N6F1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN19Q8N6F1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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