Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCL2Q8N4E4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms