Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CLIP4Q8N3C7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLIP4Q8N3C7 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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