Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ANKRD35Q8N283 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ANKRD35Q8N283 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms