Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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APLFQ8IW19 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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APLFQ8IW19 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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APLFQ8IW19 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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APLFQ8IW19 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APLFQ8IW19 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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