Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNMB4Q86W47 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms