Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TCF23Q7RTU1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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