Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms