Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPPQ6IPU0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms