Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM1

AFMID, Kynurenine formamidase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMIDQ63HM1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AFMIDQ63HM1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms