Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB6CQ53S08 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms