Protein–RNA interactions for Protein: Q53RT3

ASPRV1, Retroviral-like aspartic protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASPRV1Q53RT3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ASPRV1Q53RT3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ASPRV1Q53RT3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms