Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RFTN2Q52LD8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RFTN2Q52LD8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms