Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms