Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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