Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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LAMA3Q16787 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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