Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HIST3H3Q16695 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms