Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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ECM1Q16610 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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ECM1Q16610 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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ECM1Q16610 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ECM1Q16610 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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