Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FXNQ16595 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FXNQ16595 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FXNQ16595 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FXNQ16595 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FXNQ16595 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FXNQ16595 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FXNQ16595 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FXNQ16595 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FXNQ16595 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FXNQ16595 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FXNQ16595 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FXNQ16595 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FXNQ16595 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FXNQ16595 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FXNQ16595 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FXNQ16595 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FXNQ16595 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FXNQ16595 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FXNQ16595 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FXNQ16595 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FXNQ16595 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FXNQ16595 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FXNQ16595 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FXNQ16595 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FXNQ16595 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FXNQ16595 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FXNQ16595 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FXNQ16595 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FXNQ16595 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FXNQ16595 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FXNQ16595 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FXNQ16595 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FXNQ16595 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FXNQ16595 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FXNQ16595 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FXNQ16595 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FXNQ16595 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FXNQ16595 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FXNQ16595 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FXNQ16595 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FXNQ16595 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FXNQ16595 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FXNQ16595 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FXNQ16595 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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