Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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