Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 COX18-201ENST00000295890 6846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 LMCD1-201ENST00000157600 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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VAMP3Q15836 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
VAMP3Q15836 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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