Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALX1Q15699 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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