Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SHBQ15464 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SHBQ15464 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SHBQ15464 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHBQ15464 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SHBQ15464 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SHBQ15464 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHBQ15464 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SHBQ15464 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SHBQ15464 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SHBQ15464 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SHBQ15464 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHBQ15464 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SHBQ15464 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHBQ15464 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHBQ15464 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SHBQ15464 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHBQ15464 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SHBQ15464 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHBQ15464 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHBQ15464 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHBQ15464 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SHBQ15464 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SHBQ15464 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SHBQ15464 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SHBQ15464 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SHBQ15464 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SHBQ15464 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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SHBQ15464 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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SHBQ15464 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SHBQ15464 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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