Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SEC23BQ15437 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SEC23BQ15437 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms