Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms