Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
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CNGB1Q14028 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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CNGB1Q14028 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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CNGB1Q14028 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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CNGB1Q14028 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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CNGB1Q14028 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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CNGB1Q14028 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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CNGB1Q14028 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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CNGB1Q14028 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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CNGB1Q14028 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNGB1Q14028 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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