Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDK13Q14004 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK13Q14004 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms