Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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ITGA9Q13797 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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ITGA9Q13797 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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ITGA9Q13797 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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ITGA9Q13797 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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ITGA9Q13797 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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ITGA9Q13797 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGA9Q13797 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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