Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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SHROOM2Q13796 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHROOM2Q13796 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
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