Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP1A4Q13733 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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