Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1SQ13698 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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