Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms