Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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C1orf61Q13536 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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C1orf61Q13536 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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C1orf61Q13536 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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C1orf61Q13536 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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