Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPM6BQ13491 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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