Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DUSP4Q13115 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms