Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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BNIP1Q12981 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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BNIP1Q12981 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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BNIP1Q12981 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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BNIP1Q12981 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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BNIP1Q12981 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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BNIP1Q12981 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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BNIP1Q12981 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
BNIP1Q12981 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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