Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFIAQ12857 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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