Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBRQ0VD83 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms