Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms