Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHRNEQ04844 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms