Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ERCC6Q03468 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ERCC6Q03468 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms