Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUCB1Q02818 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUCB1Q02818 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms