Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms