Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLTCQ00610 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms