Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms