Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HBBP68871 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HBBP68871 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms