Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP46P62068 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP46P62068 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP46P62068 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP46P62068 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP46P62068 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP46P62068 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP46P62068 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP46P62068 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP46P62068 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP46P62068 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP46P62068 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP46P62068 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP46P62068 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP46P62068 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP46P62068 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP46P62068 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP46P62068 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
USP46P62068 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP46P62068 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP46P62068 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
USP46P62068 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms